Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSPNQ14714 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSPNQ14714 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSPNQ14714 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
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