Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBX1Q14549 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBX1Q14549 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBX1Q14549 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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