Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27E3Q08E93 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM27E3Q08E93 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms