Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DQ08499 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4DQ08499 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4DQ08499 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE4DQ08499 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms