Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4A11Q02928 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYP4A11Q02928 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP4A11Q02928 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms