Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PLOD1Q02809 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD1Q02809 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD1Q02809 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms