Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CACNB1Q02641 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNB1Q02641 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB1Q02641 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB1Q02641 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms