Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC2Q02487 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC2Q02487 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC2Q02487 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC2Q02487 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC2Q02487 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms