Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IL13RA1P78552 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL13RA1P78552 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms