Protein–RNA interactions for Protein: P63000

RAC1, Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAC1P63000 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAC1P63000 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAC1P63000 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAC1P63000 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAC1P63000 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAC1P63000 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAC1P63000 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAC1P63000 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAC1P63000 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAC1P63000 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAC1P63000 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAC1P63000 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAC1P63000 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAC1P63000 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAC1P63000 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAC1P63000 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAC1P63000 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAC1P63000 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAC1P63000 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAC1P63000 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAC1P63000 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAC1P63000 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAC1P63000 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAC1P63000 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAC1P63000 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAC1P63000 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAC1P63000 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAC1P63000 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAC1P63000 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAC1P63000 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAC1P63000 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAC1P63000 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAC1P63000 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAC1P63000 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAC1P63000 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAC1P63000 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAC1P63000 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAC1P63000 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RAC1P63000 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAC1P63000 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAC1P63000 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAC1P63000 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAC1P63000 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAC1P63000 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAC1P63000 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAC1P63000 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAC1P63000 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAC1P63000 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAC1P63000 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAC1P63000 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAC1P63000 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAC1P63000 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAC1P63000 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAC1P63000 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAC1P63000 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAC1P63000 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAC1P63000 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAC1P63000 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAC1P63000 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAC1P63000 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAC1P63000 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAC1P63000 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAC1P63000 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAC1P63000 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAC1P63000 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAC1P63000 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAC1P63000 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAC1P63000 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAC1P63000 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAC1P63000 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAC1P63000 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAC1P63000 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAC1P63000 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAC1P63000 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAC1P63000 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAC1P63000 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAC1P63000 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAC1P63000 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAC1P63000 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAC1P63000 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAC1P63000 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAC1P63000 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAC1P63000 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAC1P63000 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAC1P63000 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAC1P63000 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAC1P63000 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAC1P63000 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAC1P63000 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms