Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG7P62955 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNG7P62955 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNG7P62955 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNG7P62955 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNG7P62955 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNG7P62955 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNG7P62955 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNG7P62955 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNG7P62955 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNG7P62955 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms