Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCCD1P59942 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCCD1P59942 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCCD1P59942 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms