Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN15P56746 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms