Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMP3P54852 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMP3P54852 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EMP3P54852 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMP3P54852 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EMP3P54852 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMP3P54852 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMP3P54852 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMP3P54852 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMP3P54852 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMP3P54852 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMP3P54852 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMP3P54852 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMP3P54852 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMP3P54852 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMP3P54852 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMP3P54852 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMP3P54852 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMP3P54852 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMP3P54852 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMP3P54852 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EMP3P54852 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMP3P54852 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMP3P54852 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMP3P54852 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EMP3P54852 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMP3P54852 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMP3P54852 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMP3P54852 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMP3P54852 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMP3P54852 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMP3P54852 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMP3P54852 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMP3P54852 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMP3P54852 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMP3P54852 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMP3P54852 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMP3P54852 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMP3P54852 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMP3P54852 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMP3P54852 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMP3P54852 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EMP3P54852 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMP3P54852 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMP3P54852 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMP3P54852 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMP3P54852 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMP3P54852 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMP3P54852 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMP3P54852 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMP3P54852 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMP3P54852 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMP3P54852 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMP3P54852 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMP3P54852 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMP3P54852 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMP3P54852 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMP3P54852 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMP3P54852 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMP3P54852 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EMP3P54852 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMP3P54852 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMP3P54852 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EMP3P54852 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMP3P54852 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMP3P54852 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMP3P54852 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMP3P54852 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP3P54852 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMP3P54852 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMP3P54852 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMP3P54852 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP3P54852 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP3P54852 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP3P54852 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP3P54852 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP3P54852 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP3P54852 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP3P54852 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP3P54852 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP3P54852 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms