Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB1P54762 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB1P54762 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB1P54762 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB1P54762 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB1P54762 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPHB1P54762 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB1P54762 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms