Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFF1P51825 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFF1P51825 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFF1P51825 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFF1P51825 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFF1P51825 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFF1P51825 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFF1P51825 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFF1P51825 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFF1P51825 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFF1P51825 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFF1P51825 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFF1P51825 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFF1P51825 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFF1P51825 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFF1P51825 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFF1P51825 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AFF1P51825 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFF1P51825 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFF1P51825 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFF1P51825 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFF1P51825 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFF1P51825 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFF1P51825 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFF1P51825 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFF1P51825 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFF1P51825 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFF1P51825 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFF1P51825 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AFF1P51825 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFF1P51825 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFF1P51825 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFF1P51825 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AFF1P51825 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFF1P51825 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFF1P51825 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF1P51825 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF1P51825 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF1P51825 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF1P51825 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFF1P51825 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFF1P51825 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFF1P51825 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFF1P51825 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFF1P51825 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFF1P51825 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFF1P51825 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFF1P51825 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
AFF1P51825 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFF1P51825 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFF1P51825 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF1P51825 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF1P51825 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF1P51825 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF1P51825 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF1P51825 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF1P51825 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFF1P51825 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFF1P51825 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFF1P51825 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFF1P51825 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFF1P51825 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFF1P51825 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFF1P51825 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF1P51825 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF1P51825 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF1P51825 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF1P51825 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF1P51825 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFF1P51825 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
AFF1P51825 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFF1P51825 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFF1P51825 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFF1P51825 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFF1P51825 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFF1P51825 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF1P51825 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF1P51825 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF1P51825 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF1P51825 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF1P51825 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF1P51825 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF1P51825 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AFF1P51825 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFF1P51825 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFF1P51825 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFF1P51825 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFF1P51825 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF1P51825 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF1P51825 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF1P51825 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF1P51825 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF1P51825 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF1P51825 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFF1P51825 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFF1P51825 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFF1P51825 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AFF1P51825 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AFF1P51825 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFF1P51825 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms