Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A2P50993 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A2P50993 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A2P50993 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms