Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EMDP50402 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMDP50402 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMDP50402 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMDP50402 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMDP50402 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMDP50402 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMDP50402 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMDP50402 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EMDP50402 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMDP50402 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMDP50402 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMDP50402 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMDP50402 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EMDP50402 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMDP50402 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMDP50402 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMDP50402 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMDP50402 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMDP50402 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMDP50402 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMDP50402 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMDP50402 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMDP50402 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMDP50402 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EMDP50402 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMDP50402 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMDP50402 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMDP50402 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMDP50402 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMDP50402 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMDP50402 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMDP50402 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMDP50402 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EMDP50402 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMDP50402 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMDP50402 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMDP50402 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMDP50402 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMDP50402 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMDP50402 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMDP50402 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMDP50402 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMDP50402 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMDP50402 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMDP50402 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMDP50402 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMDP50402 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMDP50402 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMDP50402 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMDP50402 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMDP50402 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMDP50402 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMDP50402 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMDP50402 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMDP50402 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMDP50402 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EMDP50402 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMDP50402 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMDP50402 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMDP50402 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMDP50402 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMDP50402 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMDP50402 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMDP50402 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMDP50402 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMDP50402 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMDP50402 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMDP50402 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMDP50402 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMDP50402 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMDP50402 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMDP50402 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMDP50402 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMDP50402 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EMDP50402 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMDP50402 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMDP50402 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMDP50402 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EMDP50402 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMDP50402 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMDP50402 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMDP50402 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMDP50402 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMDP50402 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMDP50402 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMDP50402 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EMDP50402 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMDP50402 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMDP50402 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMDP50402 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMDP50402 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMDP50402 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMDP50402 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMDP50402 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMDP50402 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMDP50402 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMDP50402 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMDP50402 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMDP50402 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms