Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REG1BP48304 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REG1BP48304 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REG1BP48304 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REG1BP48304 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REG1BP48304 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REG1BP48304 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REG1BP48304 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REG1BP48304 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REG1BP48304 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REG1BP48304 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REG1BP48304 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REG1BP48304 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REG1BP48304 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REG1BP48304 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REG1BP48304 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REG1BP48304 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REG1BP48304 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REG1BP48304 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REG1BP48304 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REG1BP48304 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REG1BP48304 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REG1BP48304 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REG1BP48304 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REG1BP48304 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REG1BP48304 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REG1BP48304 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
REG1BP48304 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
REG1BP48304 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
REG1BP48304 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
REG1BP48304 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
REG1BP48304 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
REG1BP48304 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
REG1BP48304 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
REG1BP48304 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
REG1BP48304 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
REG1BP48304 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
REG1BP48304 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
REG1BP48304 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
REG1BP48304 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
REG1BP48304 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
REG1BP48304 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
REG1BP48304 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
REG1BP48304 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
REG1BP48304 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
REG1BP48304 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
REG1BP48304 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
REG1BP48304 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
REG1BP48304 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
REG1BP48304 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
REG1BP48304 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
REG1BP48304 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
REG1BP48304 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
REG1BP48304 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REG1BP48304 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REG1BP48304 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
REG1BP48304 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REG1BP48304 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REG1BP48304 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REG1BP48304 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REG1BP48304 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REG1BP48304 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REG1BP48304 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REG1BP48304 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REG1BP48304 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REG1BP48304 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REG1BP48304 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REG1BP48304 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REG1BP48304 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REG1BP48304 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REG1BP48304 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REG1BP48304 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REG1BP48304 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REG1BP48304 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REG1BP48304 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REG1BP48304 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms