Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA4P48058 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA4P48058 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA4P48058 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms