Protein–RNA interactions for Protein: P47897

QARS, Glutamine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARSP47897 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
QARSP47897 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
QARSP47897 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
QARSP47897 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
QARSP47897 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
QARSP47897 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
QARSP47897 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
QARSP47897 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
QARSP47897 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
QARSP47897 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
QARSP47897 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
QARSP47897 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
QARSP47897 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
QARSP47897 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
QARSP47897 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
QARSP47897 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
QARSP47897 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
QARSP47897 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
QARSP47897 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
QARSP47897 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
QARSP47897 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
QARSP47897 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
QARSP47897 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
QARSP47897 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
QARSP47897 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
QARSP47897 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
QARSP47897 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
QARSP47897 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
QARSP47897 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
QARSP47897 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
QARSP47897 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
QARSP47897 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
QARSP47897 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
QARSP47897 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
QARSP47897 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
QARSP47897 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
QARSP47897 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
QARSP47897 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
QARSP47897 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
QARSP47897 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
QARSP47897 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
QARSP47897 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
QARSP47897 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
QARSP47897 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
QARSP47897 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
QARSP47897 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
QARSP47897 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
QARSP47897 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
QARSP47897 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
QARSP47897 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
QARSP47897 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
QARSP47897 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
QARSP47897 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
QARSP47897 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
QARSP47897 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
QARSP47897 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
QARSP47897 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
QARSP47897 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
QARSP47897 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
QARSP47897 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
QARSP47897 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
QARSP47897 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
QARSP47897 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
QARSP47897 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
QARSP47897 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
QARSP47897 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
QARSP47897 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
QARSP47897 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
QARSP47897 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
QARSP47897 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
QARSP47897 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
QARSP47897 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
QARSP47897 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
QARSP47897 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
QARSP47897 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
QARSP47897 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
QARSP47897 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
QARSP47897 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
QARSP47897 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
QARSP47897 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
QARSP47897 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
QARSP47897 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
QARSP47897 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
QARSP47897 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
QARSP47897 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
QARSP47897 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
QARSP47897 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
QARSP47897 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
QARSP47897 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
QARSP47897 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms