Protein–RNA interactions for Protein: P43366

MAGEB1, Melanoma-associated antigen B1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEB1P43366 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB1P43366 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAGEB1P43366 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEB1P43366 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEB1P43366 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAGEB1P43366 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEB1P43366 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEB1P43366 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEB1P43366 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms