Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ELK3P41970 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ELK3P41970 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ELK3P41970 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ELK3P41970 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ELK3P41970 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ELK3P41970 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ELK3P41970 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ELK3P41970 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ELK3P41970 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ELK3P41970 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ELK3P41970 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ELK3P41970 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ELK3P41970 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ELK3P41970 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ELK3P41970 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ELK3P41970 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ELK3P41970 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ELK3P41970 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ELK3P41970 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ELK3P41970 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ELK3P41970 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELK3P41970 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELK3P41970 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELK3P41970 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELK3P41970 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELK3P41970 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELK3P41970 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELK3P41970 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELK3P41970 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELK3P41970 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELK3P41970 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELK3P41970 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELK3P41970 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELK3P41970 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELK3P41970 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELK3P41970 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELK3P41970 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELK3P41970 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELK3P41970 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELK3P41970 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ELK3P41970 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ELK3P41970 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ELK3P41970 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ELK3P41970 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ELK3P41970 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ELK3P41970 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ELK3P41970 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ELK3P41970 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ELK3P41970 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ELK3P41970 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ELK3P41970 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ELK3P41970 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ELK3P41970 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ELK3P41970 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ELK3P41970 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ELK3P41970 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ELK3P41970 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ELK3P41970 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELK3P41970 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELK3P41970 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ELK3P41970 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELK3P41970 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELK3P41970 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELK3P41970 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELK3P41970 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELK3P41970 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELK3P41970 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELK3P41970 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELK3P41970 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELK3P41970 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ELK3P41970 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELK3P41970 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELK3P41970 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELK3P41970 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELK3P41970 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELK3P41970 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELK3P41970 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELK3P41970 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELK3P41970 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELK3P41970 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELK3P41970 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELK3P41970 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELK3P41970 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELK3P41970 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ELK3P41970 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELK3P41970 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELK3P41970 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELK3P41970 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELK3P41970 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELK3P41970 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELK3P41970 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELK3P41970 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELK3P41970 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELK3P41970 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELK3P41970 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELK3P41970 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELK3P41970 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELK3P41970 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELK3P41970 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms