Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH2P40926 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH2P40926 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH2P40926 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH2P40926 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH2P40926 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH2P40926 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH2P40926 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH2P40926 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH2P40926 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH2P40926 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH2P40926 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH2P40926 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH2P40926 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH2P40926 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH2P40926 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH2P40926 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH2P40926 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH2P40926 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH2P40926 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH2P40926 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH2P40926 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDH2P40926 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH2P40926 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH2P40926 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH2P40926 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH2P40926 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH2P40926 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH2P40926 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH2P40926 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH2P40926 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH2P40926 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH2P40926 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH2P40926 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH2P40926 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH2P40926 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH2P40926 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH2P40926 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH2P40926 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH2P40926 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH2P40926 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH2P40926 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH2P40926 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH2P40926 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH2P40926 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH2P40926 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH2P40926 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH2P40926 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH2P40926 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH2P40926 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH2P40926 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH2P40926 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH2P40926 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH2P40926 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH2P40926 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH2P40926 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH2P40926 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH2P40926 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH2P40926 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDH2P40926 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH2P40926 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH2P40926 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH2P40926 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH2P40926 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MDH2P40926 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDH2P40926 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MDH2P40926 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH2P40926 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH2P40926 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH2P40926 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH2P40926 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH2P40926 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH2P40926 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH2P40926 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH2P40926 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH2P40926 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH2P40926 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH2P40926 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH2P40926 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH2P40926 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH2P40926 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH2P40926 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH2P40926 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH2P40926 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH2P40926 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH2P40926 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH2P40926 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH2P40926 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH2P40926 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH2P40926 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH2P40926 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH2P40926 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms