Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EIF4A3P38919 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF4A3P38919 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EIF4A3P38919 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms