Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC6A4P31645 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A4P31645 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC6A4P31645 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC6A4P31645 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A4P31645 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms