Protein–RNA interactions for Protein: P23083

IGHV1-2, Immunoglobulin heavy variable 1-2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-2P23083 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV1-2P23083 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV1-2P23083 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV1-2P23083 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms