Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAV1P15498 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAV1P15498 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAV1P15498 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAV1P15498 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAV1P15498 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV1P15498 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV1P15498 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV1P15498 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV1P15498 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV1P15498 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV1P15498 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV1P15498 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV1P15498 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV1P15498 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV1P15498 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV1P15498 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV1P15498 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAV1P15498 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAV1P15498 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV1P15498 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV1P15498 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV1P15498 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV1P15498 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV1P15498 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV1P15498 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV1P15498 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV1P15498 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV1P15498 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV1P15498 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV1P15498 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV1P15498 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV1P15498 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV1P15498 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV1P15498 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV1P15498 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAV1P15498 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAV1P15498 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAV1P15498 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAV1P15498 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VAV1P15498 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VAV1P15498 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAV1P15498 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAV1P15498 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAV1P15498 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAV1P15498 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VAV1P15498 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAV1P15498 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAV1P15498 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAV1P15498 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAV1P15498 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAV1P15498 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAV1P15498 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAV1P15498 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAV1P15498 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAV1P15498 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VAV1P15498 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAV1P15498 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAV1P15498 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAV1P15498 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VAV1P15498 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAV1P15498 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAV1P15498 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAV1P15498 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAV1P15498 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAV1P15498 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAV1P15498 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAV1P15498 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAV1P15498 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAV1P15498 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAV1P15498 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAV1P15498 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAV1P15498 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAV1P15498 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAV1P15498 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAV1P15498 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAV1P15498 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAV1P15498 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VAV1P15498 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAV1P15498 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAV1P15498 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV1P15498 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
VAV1P15498 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV1P15498 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV1P15498 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV1P15498 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV1P15498 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV1P15498 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV1P15498 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms