Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SKIP12755 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKIP12755 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKIP12755 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKIP12755 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKIP12755 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIP12755 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKIP12755 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKIP12755 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SKIP12755 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKIP12755 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKIP12755 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKIP12755 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKIP12755 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIP12755 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIP12755 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIP12755 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKIP12755 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKIP12755 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SKIP12755 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKIP12755 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKIP12755 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKIP12755 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SKIP12755 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SKIP12755 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SKIP12755 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIP12755 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIP12755 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIP12755 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIP12755 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIP12755 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIP12755 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIP12755 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIP12755 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIP12755 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIP12755 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIP12755 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKIP12755 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKIP12755 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKIP12755 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIP12755 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIP12755 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIP12755 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIP12755 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIP12755 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKIP12755 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKIP12755 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKIP12755 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIP12755 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIP12755 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIP12755 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIP12755 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIP12755 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIP12755 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIP12755 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIP12755 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIP12755 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIP12755 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIP12755 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIP12755 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIP12755 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIP12755 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIP12755 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIP12755 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIP12755 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIP12755 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIP12755 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIP12755 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIP12755 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIP12755 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIP12755 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIP12755 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIP12755 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIP12755 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIP12755 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIP12755 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIP12755 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIP12755 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIP12755 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIP12755 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIP12755 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIP12755 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIP12755 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIP12755 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIP12755 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIP12755 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIP12755 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKIP12755 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKIP12755 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKIP12755 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKIP12755 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SKIP12755 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms