Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFHP12036 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFHP12036 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFHP12036 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFHP12036 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFHP12036 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFHP12036 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFHP12036 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFHP12036 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFHP12036 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFHP12036 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFHP12036 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFHP12036 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFHP12036 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFHP12036 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFHP12036 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFHP12036 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFHP12036 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFHP12036 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFHP12036 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFHP12036 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFHP12036 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFHP12036 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFHP12036 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFHP12036 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFHP12036 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFHP12036 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFHP12036 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFHP12036 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFHP12036 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFHP12036 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFHP12036 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFHP12036 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFHP12036 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFHP12036 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFHP12036 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFHP12036 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFHP12036 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFHP12036 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFHP12036 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFHP12036 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFHP12036 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFHP12036 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFHP12036 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFHP12036 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFHP12036 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFHP12036 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFHP12036 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFHP12036 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFHP12036 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFHP12036 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFHP12036 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFHP12036 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFHP12036 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFHP12036 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFHP12036 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFHP12036 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFHP12036 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFHP12036 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFHP12036 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFHP12036 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFHP12036 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFHP12036 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFHP12036 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFHP12036 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFHP12036 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFHP12036 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFHP12036 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFHP12036 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFHP12036 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFHP12036 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFHP12036 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFHP12036 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFHP12036 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFHP12036 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFHP12036 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFHP12036 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFHP12036 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFHP12036 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFHP12036 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFHP12036 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEFHP12036 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFHP12036 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFHP12036 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFHP12036 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFHP12036 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFHP12036 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFHP12036 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFHP12036 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFHP12036 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFHP12036 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFHP12036 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFHP12036 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFHP12036 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFHP12036 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFHP12036 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFHP12036 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFHP12036 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFHP12036 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFHP12036 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms