Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NSA2O95478 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSA2O95478 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSA2O95478 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSA2O95478 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSA2O95478 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSA2O95478 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSA2O95478 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSA2O95478 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSA2O95478 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSA2O95478 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSA2O95478 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSA2O95478 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSA2O95478 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSA2O95478 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSA2O95478 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NSA2O95478 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSA2O95478 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSA2O95478 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSA2O95478 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSA2O95478 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSA2O95478 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSA2O95478 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSA2O95478 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSA2O95478 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSA2O95478 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSA2O95478 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSA2O95478 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSA2O95478 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSA2O95478 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NSA2O95478 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NSA2O95478 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NSA2O95478 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSA2O95478 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSA2O95478 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSA2O95478 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSA2O95478 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSA2O95478 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NSA2O95478 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSA2O95478 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSA2O95478 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSA2O95478 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSA2O95478 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSA2O95478 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSA2O95478 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSA2O95478 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSA2O95478 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSA2O95478 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSA2O95478 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSA2O95478 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSA2O95478 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSA2O95478 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSA2O95478 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSA2O95478 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSA2O95478 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSA2O95478 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSA2O95478 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSA2O95478 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSA2O95478 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSA2O95478 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSA2O95478 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSA2O95478 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSA2O95478 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSA2O95478 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSA2O95478 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSA2O95478 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSA2O95478 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSA2O95478 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSA2O95478 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSA2O95478 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSA2O95478 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSA2O95478 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSA2O95478 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSA2O95478 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSA2O95478 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSA2O95478 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSA2O95478 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSA2O95478 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSA2O95478 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSA2O95478 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSA2O95478 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSA2O95478 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSA2O95478 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSA2O95478 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSA2O95478 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSA2O95478 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSA2O95478 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSA2O95478 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSA2O95478 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSA2O95478 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSA2O95478 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSA2O95478 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms