Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN7O95471 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN7O95471 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN7O95471 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms