Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC6AO75865 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC6AO75865 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms