Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3BO75182 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SIN3BO75182 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3BO75182 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms