Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEMFO60524 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEMFO60524 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEMFO60524 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEMFO60524 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEMFO60524 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEMFO60524 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEMFO60524 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEMFO60524 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEMFO60524 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEMFO60524 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEMFO60524 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEMFO60524 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEMFO60524 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEMFO60524 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEMFO60524 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEMFO60524 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEMFO60524 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEMFO60524 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEMFO60524 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEMFO60524 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEMFO60524 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEMFO60524 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEMFO60524 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEMFO60524 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEMFO60524 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEMFO60524 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEMFO60524 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEMFO60524 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEMFO60524 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEMFO60524 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEMFO60524 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEMFO60524 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEMFO60524 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEMFO60524 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEMFO60524 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEMFO60524 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEMFO60524 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEMFO60524 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEMFO60524 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEMFO60524 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEMFO60524 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEMFO60524 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEMFO60524 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEMFO60524 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEMFO60524 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NEMFO60524 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEMFO60524 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEMFO60524 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEMFO60524 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEMFO60524 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEMFO60524 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEMFO60524 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEMFO60524 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEMFO60524 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEMFO60524 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEMFO60524 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEMFO60524 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEMFO60524 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEMFO60524 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEMFO60524 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEMFO60524 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEMFO60524 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEMFO60524 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEMFO60524 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEMFO60524 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEMFO60524 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEMFO60524 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEMFO60524 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEMFO60524 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEMFO60524 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEMFO60524 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEMFO60524 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMFO60524 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMFO60524 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMFO60524 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMFO60524 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMFO60524 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMFO60524 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMFO60524 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEMFO60524 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEMFO60524 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEMFO60524 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEMFO60524 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEMFO60524 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NEMFO60524 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEMFO60524 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEMFO60524 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEMFO60524 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEMFO60524 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEMFO60524 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NEMFO60524 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEMFO60524 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEMFO60524 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms