Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF9O43307 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF9O43307 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 364.2 ms