Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODHO43272 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODHO43272 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODHO43272 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODHO43272 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODHO43272 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODHO43272 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODHO43272 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODHO43272 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODHO43272 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODHO43272 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODHO43272 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODHO43272 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODHO43272 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODHO43272 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODHO43272 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODHO43272 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODHO43272 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODHO43272 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODHO43272 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRODHO43272 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRODHO43272 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODHO43272 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODHO43272 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODHO43272 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODHO43272 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODHO43272 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODHO43272 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODHO43272 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODHO43272 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODHO43272 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODHO43272 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODHO43272 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODHO43272 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODHO43272 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODHO43272 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODHO43272 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODHO43272 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODHO43272 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODHO43272 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODHO43272 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODHO43272 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODHO43272 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRODHO43272 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRODHO43272 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRODHO43272 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRODHO43272 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRODHO43272 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRODHO43272 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRODHO43272 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRODHO43272 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRODHO43272 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRODHO43272 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRODHO43272 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRODHO43272 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRODHO43272 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODHO43272 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODHO43272 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODHO43272 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODHO43272 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODHO43272 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODHO43272 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODHO43272 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODHO43272 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRODHO43272 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRODHO43272 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRODHO43272 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRODHO43272 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRODHO43272 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRODHO43272 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODHO43272 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODHO43272 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODHO43272 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODHO43272 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODHO43272 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODHO43272 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODHO43272 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODHO43272 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODHO43272 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODHO43272 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODHO43272 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRODHO43272 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRODHO43272 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRODHO43272 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRODHO43272 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODHO43272 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODHO43272 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODHO43272 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODHO43272 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODHO43272 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODHO43272 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRODHO43272 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms