Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TP73O15350 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TP73O15350 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TP73O15350 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TP73O15350 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TP73O15350 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TP73O15350 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TP73O15350 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TP73O15350 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TP73O15350 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TP73O15350 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TP73O15350 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP73O15350 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP73O15350 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP73O15350 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP73O15350 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP73O15350 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TP73O15350 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TP73O15350 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP73O15350 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP73O15350 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP73O15350 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP73O15350 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP73O15350 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TP73O15350 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP73O15350 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP73O15350 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TP73O15350 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP73O15350 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TP73O15350 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP73O15350 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TP73O15350 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TP73O15350 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TP73O15350 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TP73O15350 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TP73O15350 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TP73O15350 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP73O15350 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP73O15350 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP73O15350 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP73O15350 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP73O15350 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TP73O15350 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TP73O15350 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TP73O15350 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TP73O15350 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TP73O15350 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TP73O15350 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP73O15350 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP73O15350 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP73O15350 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP73O15350 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP73O15350 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TP73O15350 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TP73O15350 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TP73O15350 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TP73O15350 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TP73O15350 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TP73O15350 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TP73O15350 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP73O15350 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TP73O15350 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP73O15350 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP73O15350 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TP73O15350 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP73O15350 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TP73O15350 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TP73O15350 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TP73O15350 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TP73O15350 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TP73O15350 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TP73O15350 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP73O15350 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP73O15350 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP73O15350 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP73O15350 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP73O15350 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TP73O15350 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TP73O15350 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TP73O15350 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP73O15350 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP73O15350 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TP73O15350 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TP73O15350 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TP73O15350 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TP73O15350 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TP73O15350 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TP73O15350 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TP73O15350 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TP73O15350 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TP73O15350 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TP73O15350 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TP73O15350 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TP73O15350 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP73O15350 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP73O15350 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP73O15350 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP73O15350 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TP73O15350 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TP73O15350 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms