Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD12O00232 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD12O00232 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD12O00232 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD12O00232 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms