Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BML4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BML4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BML4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BML4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BML4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BML4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BML4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BML4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BML4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BML4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BML4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BML4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BML4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BML4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BML4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BML4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BML4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BML4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BML4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BML4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BML4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BML4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BML4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BML4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BML4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BML4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BML4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BML4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BML4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BML4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BML4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BML4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BML4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BML4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BML4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BML4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BML4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BML4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BML4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BML4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BML4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BML4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BML4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BML4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BML4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BML4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BML4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BML4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BML4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BML4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BML4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BML4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BML4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BML4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BML4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BML4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BML4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BML4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BML4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BML4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BML4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
H3BML4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BML4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BML4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BML4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BML4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BML4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BML4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BML4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BML4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BML4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BML4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BML4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BML4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BML4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BML4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BML4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BML4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BML4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms