Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
EIF3CLB5ME19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EIF3CLB5ME19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF3CLB5ME19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3CLB5ME19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms