Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
B4E1Z4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
B4E1Z4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
B4E1Z4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4E1Z4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4E1Z4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
B4E1Z4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
B4E1Z4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4E1Z4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4E1Z4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4E1Z4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
B4E1Z4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4E1Z4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4E1Z4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4E1Z4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
B4E1Z4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
B4E1Z4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
B4E1Z4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
B4E1Z4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
B4E1Z4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
B4E1Z4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
B4E1Z4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
B4E1Z4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4E1Z4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4E1Z4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4E1Z4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4E1Z4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4E1Z4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
B4E1Z4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
B4E1Z4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
B4E1Z4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4E1Z4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4E1Z4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4E1Z4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4E1Z4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4E1Z4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4E1Z4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
B4E1Z4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
B4E1Z4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
B4E1Z4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
B4E1Z4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
B4E1Z4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
B4E1Z4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
B4E1Z4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
B4E1Z4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
B4E1Z4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
B4E1Z4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
B4E1Z4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4E1Z4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4E1Z4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4E1Z4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4E1Z4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4E1Z4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4E1Z4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4E1Z4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4E1Z4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4E1Z4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4E1Z4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4E1Z4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4E1Z4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4E1Z4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4E1Z4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4E1Z4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4E1Z4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4E1Z4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4E1Z4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4E1Z4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4E1Z4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4E1Z4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
B4E1Z4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
B4E1Z4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
B4E1Z4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
B4E1Z4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
B4E1Z4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4E1Z4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4E1Z4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4E1Z4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4E1Z4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
B4E1Z4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
B4E1Z4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4E1Z4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4E1Z4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4E1Z4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4E1Z4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4E1Z4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4E1Z4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4E1Z4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4E1Z4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4E1Z4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms