Protein–RNA interactions for Protein: A8MX80

Putative UPF0607 protein ENSP00000383144, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MX80 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A8MX80 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A8MX80 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A8MX80 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A8MX80 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A8MX80 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A8MX80 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A8MX80 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A8MX80 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A8MX80 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A8MX80 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
A8MX80 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MX80 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MX80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MX80 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MX80 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MX80 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A8MX80 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A8MX80 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A8MX80 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A8MX80 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A8MX80 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A8MX80 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A8MX80 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A8MX80 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MX80 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MX80 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MX80 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MX80 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MX80 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MX80 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MX80 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MX80 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MX80 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MX80 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MX80 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MX80 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MX80 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A8MX80 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A8MX80 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A8MX80 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A8MX80 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A8MX80 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A8MX80 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A8MX80 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A8MX80 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MX80 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A8MX80 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A8MX80 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A8MX80 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MX80 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MX80 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MX80 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MX80 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MX80 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MX80 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A8MX80 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A8MX80 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A8MX80 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A8MX80 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A8MX80 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A8MX80 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A8MX80 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A8MX80 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A8MX80 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A8MX80 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A8MX80 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A8MX80 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MX80 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MX80 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MX80 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MX80 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MX80 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MX80 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MX80 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MX80 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MX80 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MX80 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MX80 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MX80 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms