Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
WASHC1A8K0Z3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC1A8K0Z3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WASHC1A8K0Z3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms