Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L4A6NEF3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6L4A6NEF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6L4A6NEF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms