Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCCD1A6NED2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCCD1A6NED2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RCCD1A6NED2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCCD1A6NED2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCCD1A6NED2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms