Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP17L4A6NCW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L4A6NCW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
USP17L4A6NCW7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L4A6NCW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms