Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM30A4D0T7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM30A4D0T7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms