Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWA8A3KMH1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA8A3KMH1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA8A3KMH1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms