Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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